Dans ce thème, nous allons aborder deux types de relation entre l'être humain et les microorganismes et les replacer dans les écosystèmes dans lesquelles elles évoluent :

- des relations avec des agents pathogènes qui peuvent avoir une très grande importance en santé publique, en France, comme au niveau mondial car ils sont responsables de potentielles flambées épidémiques (voir séquence 1) ;

- des relations bénéfiques de type symbiotique où les microorganismes remplissent des fonctions contribuant à la santé de notre organisme (voir séquence 2).